- アオウオ属(2)
- アブラボテ属(47)
- アブラミス属(0)
- アルブルヌス属(1)
- ウグイ属(154)
- オプサリディウム属(5)
- カトゥラ属(0)
- カトゥロカルピオ属(1)
- カマツカ属(40)
- カワバタモロコ属(1)
- カワムツ属(109)
- キルリヌス属(1)
- クセノキプリス属(0)
- コイ属(99)
- コクレン属(1)
- コレオレウシスカス属(0)
- ゴビオ属(0)
- スカルディニウス属(0)
- スクアリウス属(0)
- スゴモロコ属(40)
- スピニバルブス属(0)
- セモティルス属(1)
- ゼゼラ属(1)
- ソウギョ属(11)
- タナゴ属(62)
- タモロコ属(53)
- ダニオ属(0)
- チャノディクティス属(2)
- ツチフキ属(2)
- ティンカ属(0)
- トール属(1)
- ニゴイ属(44)
- ノコミス属(1)
- ノテミゴーナス属(2)
- ハクレン属(19)
- ハス属(143)
- ハンパラ属(1)
- バラタナゴ属(51)
- バランティオケイロス属(0)
- バルブス属(1)
- バルボリニュムス属(1)
- ヒガイ属(10)
- ヒナモロコ属(0)
- ヒメハヤ属(94)
- フナ属(123)
- プンティウス属(0)
- ヘミクルター属(8)
- ムギツク属(6)
- メガロブラマ属(3)
- モツゴ属(64)
- ラベオ属(1)
- ルキシルス属(1)
- ルティルス属(0)
- レウシスカス属(1)
- ワタカ属(10)
- 属間交雑(コイ科)(3)
- 未同定属(コイ科)(1)
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