- アカマンボウ目 (43)
- アシロ目 (57)
- アミア目 (1)
- アンコウ目 (203)
- ウナギ目 (1141)
- オステオグロッサム目 (6)
- カダヤシ目 (50)
- カライワシ目 (36)
- カラシン目 (22)
- カレイ目 (1165)
- カワカマス目 (4)
- カンムリキンメダイ目 (1)
- ガマアンコウ目 (11)
- ガー目 (8)
- キンメダイ目 (802)
- ギンメダイ目 (62)
- コイ目 (1538)
- サケスズキ目 (1)
- サケ目 (920)
- シャチブリ目 (6)
- スズキ目 (41459)
- ソコギス目 (0)
- ソトイワシ目 (40)
- タウナギ目 (8)
- タラ目 (329)
- ダツ目 (490)
- チョウザメ目 (5)
- デンキウナギ目 (0)
- トウゴロウイワシ目 (192)
- トゲウオ目 (449)
- ナマズ目 (418)
- ニギス目 (21)
- ニシン目 (739)
- ネズミギス目 (16)
- ハダカイワシ目 (33)
- ヒメ目 (559)
- フグ目 (3684)
- ボラ目 (269)
- ポリプテルス目 (0)
- マトウダイ目 (88)
- ワニトカゲギス目 (38)